Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brd1E9PZ26 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brd1E9PZ26 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms