Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc8E9PWG2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms