Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3298E9PW80 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms