Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp839E9PUU5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms