Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3bE9PUL3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms