Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cngb1E1AZ71 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cngb1E1AZ71 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms