Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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BC035044E0CXF8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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BC035044E0CXF8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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BC035044E0CXF8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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BC035044E0CXF8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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