Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nxpe3B9EKK6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms