Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11bB4XVQ1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11bB4XVQ1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11bB4XVQ1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11bB4XVQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Phf11bB4XVQ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11bB4XVQ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms