Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms