Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cyp26c1B2RXA7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms