Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms