Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5483B2RV77 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms