Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apba1B2RUJ5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms