Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp40B1B1D3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp40B1B1D3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp40B1B1D3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp40B1B1D3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp40B1B1D3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp40B1B1D3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms