Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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