Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik3B1AS29 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms