Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M5A7VMS3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms