Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll11A4Q9F4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms