Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf39A2RT81 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf39A2RT81 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms