Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms