Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms