Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pkd2l1A2A259 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms