Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms