Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt6bQ9Z331 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt6bQ9Z331 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms