Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms