Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn7Q9Z261 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn7Q9Z261 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn7Q9Z261 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn7Q9Z261 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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