Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms