Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VarsQ9Z1Q9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VarsQ9Z1Q9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms