Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cpne6Q9Z140 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cpne6Q9Z140 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cpne6Q9Z140 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne6Q9Z140 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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