Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms