Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AireQ9Z0E3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AireQ9Z0E3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AireQ9Z0E3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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AireQ9Z0E3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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