Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms