Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubd1Q9R1K7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms