Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms