Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms