Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phtf1Q9QZ09 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phtf1Q9QZ09 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms