Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd4Q9QY39 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms