Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxe3Q9QY14 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms