Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc5Q9QX29 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms