Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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