Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms