Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AtrQ9JKK8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms