Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uchl3Q9JKB1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uchl3Q9JKB1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms