Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnga3Q9JJZ8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms