Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smpd3Q9JJY3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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