Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms