Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn12Q9ET43 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn12Q9ET43 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn12Q9ET43 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms