Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tlnrd1Q9ERE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlnrd1Q9ERE8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tlnrd1Q9ERE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms