Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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